Описание кафедры
Кафедра биоинформатики и математической биологии СПбАУ РАН им. Ж.И. Алферова осуществляет подготовку студентов по общеобразовательным курсам разделов математики, а также подготовку студентов по профилям обучения «Биоинформатика» и «Цифровая физика».
Биоинформатика – активно развивающееся междисциплинарное направление, объединяющая биологию, генетику, химию, компьютерные науки, математику и статистику и специализирующееся на крупномасштабных биологических проблемах, требующих анализа больших объемов данных. Эта область включает в себя изучение и разработку компьютерных методов и направлена на получение, анализ, хранение, организацию и визуализацию биологических данных.
Направления обучения
Кафедра биоинформатики и математической биологии ведет подготовку специалистов всех трех ступеней обучения:
Бакалавриат
Профиль «Биоинформатика» (направление 03.03.01 – «Прикладные математика и физика»)
Профиль «Цифровая физика»
Магистратура
Профиль «Алгоритмическая биоинформатика» (направление 03.04.01 – «Прикладные математика и физика»)
Аспирантура
Профиль «Математическая логика, алгебра и теория чисел» (направление 01.06.01 – «Математика и механика»
Профиль «Теоретические основы информатики» (направление 09.06.01 – «Информатика и вычислительная техника»)
Базовые курсы
Обучение по профилю «Биоинформатика» предполагает углубленную подготовку в области теории алгоритмов и разработки программного обеспечения, наряду с которой студенты получают знания в области физики, химии и биологии, необходимые для анализа данных современной геномики, протеомики, транскриптомики и метаболомики. В учебные планы включены также курсы по математической, системной и структурной биологии, биотехнологии и биостатистике. Для чтения специальных курсов будут приглашаться эксперты международного уровня в соответствующих областях.
Профиль «Цифровая физика» нацелен на подготовку специалистов в области математического моделирование физических процессов. Основой здесь, помимо серьезной базовой физико-математической подготовки, является глубокое изучение языков программирования, численных методов, дискретной математики, машинного обучения и специализированного программного обеспечения для моделирования. Студенты получают навыки построения, адаптации и анализа математических моделей в естественных науках, а также разработки программного обеспечения для осуществления вычислений и работы с данными.
Давыдов Роман Вадимович
Должность:
Заведующий кафедрой,
Преподаваемые дисциплины:
Численные методы, гр. 202, 401
Ученая степень
Кандидат физико-математических наук
Андреев Юрий Александрович
Должность:
Преподаватель, кафедра биоинформатики и математической биологии
Преподаваемые дисциплины:
Машинное и глубинное обучение, Обучение с подкреплением, Анализ изображений.
Евсюков Игорь Валерьевич
Должность:
Старший преподаватель, кафедра биоинформатики и математической биологии
Преподаваемые дисциплины:
Введение в биоинформатику, Биоинформатика рака
Зайцева Анна Юрьевна
Должность:
Доцент, кафедра биоинформатики и математической биологии
Преподаваемые дисциплины:
Сенсорные системы для медико-биологических исследований, гр. 604
Ученая степень:
Кандидат физико-математических наук
Крашенинников Сергей Вениаминович
Должность:
Доцент, кафедра биоинформатики и математической биологии
Преподаваемые дисциплины:
Операционная система Unix (лекции и практика), C и C++, Программирование для WEB, Параллельное программирование, гр. 102, 202, 302
Ученая степень:
Кандидат наук
Ученое звание:
Старший научный сотрудник
Степанова Анастасия Борисовна
Должность:
Доцент, кафедра биоинформатики и математической биологии
Преподаваемые дисциплины:
Экобезопасность при проведении исследований в области БИ и БТ, методология СБ,
Ученая степень:
Кандидат биологических наук
Ученое звание:
Доцент
Устинов Александр Борисович
Должность:
Доцент, кафедра биоинформатики и математической биологии
Преподаваемые дисциплины:
Python (лекция и практика), Разработка пользовательского интерфейса, гр. 101, 102, 302
Ученая степень:
Трудоустройство
Студенты кафедры принимают участие в исследовательских проектах, реализуемых на базе лаборатории биоинформатики и математической биологии совместно с Северо-западной Тихоокеанской национальной лабораторией (США), Медицинским центром университета Эразмус (Нидерланды), Высшей политехнической школы Лозанны (Швейцария) и другими ведущими научными центрами, а также с компаниями Spectroswiss (Швейцария) и CureLab Oncology (США). Планируется организация стажировок студентов в российских и зарубежных университетах и биотехнологических компаниях. Выпускники кафедры биоинформатики и математической биологии будут востребованы в различных областях науки и технологий, подразумевающих обработку данных биологии и медицины. По окончании магистратуры возможно продолжение обучения на кафедре в аспирантуре.
